Xiyao Li

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视觉计算实验室参加2023中国计算机大会

2023年10月25日-29日,2023中国计算机大会(CNCC2023)如期于辽宁省沈阳市新世界博览馆举办,主题为“发展数字基础设施,支撑数字中国建设”。本次大会由中国计算机学会(CCF)主办,邀请超过800位专家讲者、吸引逾1.3万人注册参加。视觉计算实验室师生代表参加本次大会,参与大会特邀报告、大会论坛、技术论坛、特色展览等多个环节的活动。 CNCC是宏观论述技术趋势的大会,具有规格高、规模大、内容丰富的特点。二十年来,大会紧跟学术前沿,邀请国内外优秀学者、业界专家莅临并做专题报告, »

视觉计算实验室举行2022级硕士研究生开题预答辩

为做好实验室2022级硕士研究生培养工作,了解学生学位论文开题进展,视觉计算实验室于2023年10月16日晚在318实验室举行2022级硕士研究生开题预答辩。2022级部分硕士研究生参加本次预答辩,实验室负责人朱敏教授作为评审专家进行指导,并邀请实验室各研究方向技术负责人参与指导。 本次预答辩涉及可视分析、生物信息学、医学图像处理等研究方向。四位答辩人从选题背景、国内外研究现状、研究内容、时间规划等角度阐述个人选题,并进行模拟问辩环节。朱敏教授从选题的可行性出发,针对内容存在的问题进行点评,为每位答辩人给出了宝贵而实用的意见。各方向技术负责人则针对细节上的薄弱之处提出了修改建议,以尽快达到开题要求。 »

视觉计算实验室参加第八届中国计算机学会生物信息学会议

第八届中国计算机学会生物信息学会议(CBC2023)于2023年8月6日-8日在乌鲁木齐举行。本次会议由中国计算机学会(CCF)主办,CCF生物信息学专委会、新疆大学承办。视觉计算实验室师生参加本次会议。 本次会议在6日先进行生物信息学专委会换届选举与专委会执行委员增补环节,并投票选举CBC2024的举办地。大会开幕式环节,由新疆大学校领导及协办单位领导致欢迎辞,CCF生物信息专委会主任致辞。本次会议邀请了国内外生物信息学领域的著名专家学者作大会报告,并对生物信息学领域的最新研究动向进行分组汇报。两天的会议报告涉及基因组学、转录组学、蛋白质组学、药物设计、医学图像等生物信息学的多个领域,为从事生物信息学研究的专家学者提供了一个学术交流的平台。 精彩回顾: 1. 邀请报告:AI驱动的药物靶标发现研究 »

浙江省生物信息学学会“生信数据分析与可视化培训班”实录-Part3

(接上篇) 5. Bulk转录组数据分析:  转录组课程主要围绕以下四个问题展开:下一代测序技术的发展以及在转录组中的应用;RNA-Seq 数据上游分析流程;基于R 的RNA-Seq 数据下游分析流程;多样本的共表达网络和功能模块挖掘。其中,后两个方面更偏向于生物信息专业的学生,对于计算机专业的学生而言,应该重点掌握实验的原理与数据库的构建,前两个问题的具体内容如下: 1) 下一代测序技术的发展以及在转录组中的应用  下一代测序技术(NGS)的流程包括文库准备、簇生成与富集、边合成边测序、同时对数十亿个簇进行多通道处理四个方面。由于NGS具有低成本、高通量、 »

浙江省生物信息学学会“生信数据分析与可视化培训班”实录-Part2

(接上篇) 3.R语言基础 本节由南京大学陈迪俊副教授主讲,着重介绍R语言在生信中进行数据分析和绘制科研图表的强大能力,主要包括:R包的安装与使用,向量、矩阵、数组、列表、数据框的结构与运算规则、线性回归与方差分析实战,以及使用R原生绘图和后续使用Adobe Illustrator(AI)对矢量图的布局与排版等,帮助我们绘制出精美的论文图表。 首先,我们需要对R语言的特性建立认识。课上了解到,R语言是一门统计语言,主要用于数学建模、统计计算、数据处理、可视化等几个方向, »

浙江省生物信息学学会“生信数据分析与可视化培训班”实录-Part1

西湖美景三月天,来自全国的生物信息学研究人员在小长假齐聚美丽杭州,于浙江大学紫金港校区生命科学学院生物信息学实验室,开展本年度浙江省生物信息学学会“生信研习班”系列科普培训活动。本次活动主题为“生物信息数据分析与可视化”,主讲人为浙江大学陈铭教授及其博士团队,以及南京大学陈迪俊副教授及其博士团队。 1. 前言——组学研究概述  在研习班开课阶段,陈铭教授介绍了生物信息学在后基因组时代面临的挑战,以及蓬勃发展的测序技术如何应用到科学研究中,同时介绍了在生物数据量持续膨胀的今天,生信分析能为科学研究带来哪些结果等。  陈铭教授在授课过程中,反复将生物信息学比作"大象",他表示,未来的研究中,哪怕是极小的分支,都要把它当作大象来看,不能片面对待。 »