Xiyao Li

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视觉计算实验室参加第八届中国计算机学会生物信息学会议

第八届中国计算机学会生物信息学会议(CBC2023)于2023年8月6日-8日在乌鲁木齐举行。本次会议由中国计算机学会(CCF)主办,CCF生物信息学专委会、新疆大学承办。视觉计算实验室师生参加本次会议。 本次会议在6日先进行生物信息学专委会换届选举与专委会执行委员增补环节,并投票选举CBC2024的举办地。大会开幕式环节,由新疆大学校领导及协办单位领导致欢迎辞,CCF生物信息专委会主任致辞。本次会议邀请了国内外生物信息学领域的著名专家学者作大会报告,并对生物信息学领域的最新研究动向进行分组汇报。两天的会议报告涉及基因组学、转录组学、蛋白质组学、药物设计、医学图像等生物信息学的多个领域,为从事生物信息学研究的专家学者提供了一个学术交流的平台。 精彩回顾: 1. 邀请报告:AI驱动的药物靶标发现研究 »

浙江省生物信息学学会“生信数据分析与可视化培训班”实录-Part3

(接上篇) 5. Bulk转录组数据分析:  转录组课程主要围绕以下四个问题展开:下一代测序技术的发展以及在转录组中的应用;RNA-Seq 数据上游分析流程;基于R 的RNA-Seq 数据下游分析流程;多样本的共表达网络和功能模块挖掘。其中,后两个方面更偏向于生物信息专业的学生,对于计算机专业的学生而言,应该重点掌握实验的原理与数据库的构建,前两个问题的具体内容如下: 1) 下一代测序技术的发展以及在转录组中的应用  下一代测序技术(NGS)的流程包括文库准备、簇生成与富集、边合成边测序、同时对数十亿个簇进行多通道处理四个方面。由于NGS具有低成本、高通量、 »

浙江省生物信息学学会“生信数据分析与可视化培训班”实录-Part2

(接上篇) 3.R语言基础 本节由南京大学陈迪俊副教授主讲,着重介绍R语言在生信中进行数据分析和绘制科研图表的强大能力,主要包括:R包的安装与使用,向量、矩阵、数组、列表、数据框的结构与运算规则、线性回归与方差分析实战,以及使用R原生绘图和后续使用Adobe Illustrator(AI)对矢量图的布局与排版等,帮助我们绘制出精美的论文图表。 首先,我们需要对R语言的特性建立认识。课上了解到,R语言是一门统计语言,主要用于数学建模、统计计算、数据处理、可视化等几个方向, »

浙江省生物信息学学会“生信数据分析与可视化培训班”实录-Part1

西湖美景三月天,来自全国的生物信息学研究人员在小长假齐聚美丽杭州,于浙江大学紫金港校区生命科学学院生物信息学实验室,开展本年度浙江省生物信息学学会“生信研习班”系列科普培训活动。本次活动主题为“生物信息数据分析与可视化”,主讲人为浙江大学陈铭教授及其博士团队,以及南京大学陈迪俊副教授及其博士团队。 1. 前言——组学研究概述  在研习班开课阶段,陈铭教授介绍了生物信息学在后基因组时代面临的挑战,以及蓬勃发展的测序技术如何应用到科学研究中,同时介绍了在生物数据量持续膨胀的今天,生信分析能为科学研究带来哪些结果等。  陈铭教授在授课过程中,反复将生物信息学比作"大象",他表示,未来的研究中,哪怕是极小的分支,都要把它当作大象来看,不能片面对待。 »

视觉计算实验室举行2020级硕士研究生学位论文预答辩

2023年4月2日上午9点,视觉计算实验室2020级硕士研究生学位论文预答辩于四川大学基础教学楼B座3楼会议室进行。本次预答辩邀请了来自电子科技大学、成都信息工程大学、中电科第三十研究所和四川大学的多位硕博士导师,组成答辩专家组,实验室负责人朱敏老师担任预答辩主席。实验室全体研究生参加本次会议。 2020级硕士学位论文涉及研究方向包括图像处理、生物信息以及可视分析等领域,整体答辩流程包括PPT展示,以及30分钟评委提问与点评环节。7名同学分别从论文主题、研究背景、主要工作、创新点、结论与展望等多个方面依次进行答辩。答辩专家组针对每位同学的工作特点,从论文的选题背景、逻辑结构、实验设计、PPT展示等角度指出存在的问题,给出具体而全面的专业指导意见。答辩研究生回答专家组的问题并全程记录。 答辩结束后,专家组经过充分讨论, »