Gan Lin

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浙江省生物信息学学会“生信数据分析与可视化培训班”实录-Part3

(接上篇) 5. Bulk转录组数据分析:  转录组课程主要围绕以下四个问题展开:下一代测序技术的发展以及在转录组中的应用;RNA-Seq 数据上游分析流程;基于R 的RNA-Seq 数据下游分析流程;多样本的共表达网络和功能模块挖掘。其中,后两个方面更偏向于生物信息专业的学生,对于计算机专业的学生而言,应该重点掌握实验的原理与数据库的构建,前两个问题的具体内容如下: 1) 下一代测序技术的发展以及在转录组中的应用  下一代测序技术(NGS)的流程包括文库准备、簇生成与富集、边合成边测序、同时对数十亿个簇进行多通道处理四个方面。由于NGS具有低成本、高通量、 »

浙江省生物信息学学会“生信数据分析与可视化培训班”实录-Part1

西湖美景三月天,来自全国的生物信息学研究人员在小长假齐聚美丽杭州,于浙江大学紫金港校区生命科学学院生物信息学实验室,开展本年度浙江省生物信息学学会“生信研习班”系列科普培训活动。本次活动主题为“生物信息数据分析与可视化”,主讲人为浙江大学陈铭教授及其博士团队,以及南京大学陈迪俊副教授及其博士团队。 1. 前言——组学研究概述  在研习班开课阶段,陈铭教授介绍了生物信息学在后基因组时代面临的挑战,以及蓬勃发展的测序技术如何应用到科学研究中,同时介绍了在生物数据量持续膨胀的今天,生信分析能为科学研究带来哪些结果等。  陈铭教授在授课过程中,反复将生物信息学比作"大象",他表示,未来的研究中,哪怕是极小的分支,都要把它当作大象来看,不能片面对待。 »