7月16日,第十届国际三维基因组学研讨会继续进行,多位国内外知名研究者进行报告。
Evolution and Function of the 3D Genome
报告人:任兵(加州大学圣地亚哥分校)
任兵教授的研究直面染色质结构在基因调控中的作用这一基本科学问题。其团队进行了比较表观基因组分析,以表征基因调控程序和3D基因组的演变。其分析表明,表观基因组和三维基因组与转录体共同进化,在整个哺乳动物进化过程中对基因组组织的选择性压力保持着保守的基因调控。所获得的更多证据表明,转座因子可能是物种特异性转录调控元件和拓扑关联域(TAD)的重要来源。
Visualization of chromosomal movement induced by heterologous fusions reflects genomic organization homeostasis in the mammalian nucleus
报告人:李劲松(中国科学院分子细胞科学卓越创新中心)
李劲松教授的研究揭示了染色体的活动机制。其团队开发了一种下采样方法,将人类的Hi-C数据转换成仿真单细胞矩阵,在具有不同染色体融合事件的细胞中保留原始基因组最突出的功能性三维结构特征。通过在单细胞水平上显示高分辨率的染色体运动来弥合目前散状Hi-C和单细胞Hi-C分析之间的差距,分析表明在染色体融合之后三维基因组组织保持稳定,染色体空间位置的微小重新调整是根据它们在产生的细胞和动物中的极化位置在短时间内进行的。
Characterize Alzheimer's disease genetic association in the 3D genome
报告人:沈音(加州大学旧金山分校)
沈音教授的研究关注三维基因组中阿尔兹海默症(AD)的遗传关联机制。其团队通过实验筛选并验证潜在变异体,建立了功能性AD风险变异体与其靶基因之间的联系,还通过等位基因分析和素数编辑对AD优先变异体的功能影响进行了碱基对评估。该工作是第一次通过系统实验充分证明了AD优先变异体在小胶质细胞转录调控和下游生理条件中的功能作用。
Image-based Spatial Genomics in Health and Disease
报告人:王思远(耶鲁大学)
王思远教授的研究试图理解三位基因组在不同生物医学过程中的调节机制和功能。其团队开发了基于图像的三维基因组学和空间多组学技术,用于绘制单个细胞和复杂哺乳动物组织中的三维基因组和多基因组图,并系统地识别了三维基因组的新新调控物。 这些新的调控因子可能成为新的治疗靶点,以阻止甚至逆转疾病中有害的三维基因组改变。总之,科学问题包括: 1)用新的技术发展来描述三维基因组;2)了解三维基因组在健康和疾病中的功能;3)构建三维基因组“调节体”来操纵三维基因组。